教育经历
- 1995-1999，华中农业大学，食品科技系，食品科学与工程，学士
- 1999-2006，华中农业大学-jk萝莉 ，生物医药工程（生物技术），博士
工作经历
- 2006-2009，jk萝莉 ，讲师
- 2009-2016，jk萝莉 ，副教授
- 2016-至今，jk萝莉 ，研究员
研究内容
- 食源性致病菌快速检测分型与风险评估
- 食源性致病菌菌膜形成分子机制
- 食源性致病菌耐药形成传播机制
承担项目
- 1) 2024年9月-2027年8月，基于全健康的中英细菌耐药动态变化规律及驱动因素研究，国家重点研发计划政府间国际科技创新合作重点专项，2024YFE0199000，1200万元，主持人
- 2) 2025年1月-2028年12月，依赖pycA的金黄色葡萄球菌内源性H2S调控机制，国家自然科学基金面上项目，32472458，50万元，主持人
- 3) 2024年10月-2027年9月，肽聚糖水解酶Sle1介导的金黄色葡萄球菌毒力/耐药制衡机制，上海市自然科学基金面上项目，24ZR1436200，20万元，主持人
- 4) 2023年10月-2024年10月，多重耐药沙门氏菌基因组溯源和传播预警，上海市食品安全风险评估项目，RA-2023-12，18万元，主持人
- 5) 2021年7月-2024年6月，鲜食农产品致病菌污染快速检测产品开发及应用，上海市科委农业领域项目，21N31900200，70万元，主持人
- 6) 2020年6月22-2023年6月21，上海地区生猪养殖-屠宰-加工-消费环节重要耐药致病菌的流行及防控，上海市科技兴农项目，2020-02-08-00-08-F01487，99.98万元，主持人
- 7) 2020年1月-2023年12月，萘替芬衍生物对金黄色葡萄球菌黄素合成和生物膜形成的双效抑制机制，国家自然科学基金面上项目，31972169，58万元，主持人
- 8) 2018年1月-2021年12月，重要食源性致病菌耐药机制及传播规律研究，国家重点研发计划“食品安全关键技术研发”专项，2017YFC1600100，2980万元，主持人
- 9) 2017年1月-2020年12月，葡萄球菌黄素合成与菌膜形成的相关性及其分子调控机制，国家自然科学基金面上项目，31671943，63万元，主持人
- 10) 2016年7月-2020年12月，跨境食品潜在、新发病原微生物筛查监控技术及溯源平台建设，国家重点研发计划项目“跨境食品品质与质量控制数据库构建及创新集成开发”，2016YFD0401102，88/494/2600万元，子课题主持人
论文
- 1) Li J, Hou W, Chang J, Tian X, He M, Zhang Z, Shi C*. (2025) The pivotal role of acnA in linking carbon metabolism to virulence and antimicrobial resistance in methicillin-resistant Staphylococcus aureus. Journal of Antimicrobial Chemotherapy, dkaf317, //doi.org/10.1093/jac/dkaf317.
- 2) Mai ZF, Li JH, Zhan ZQ, Tian XR, Hou WW, He M, Shi CL*. (2025) Metabolic master switch: pyruvate carboxylase fuels antimicrobial resistance and virulence in foodborne Staphylococcus aureus. Foods, 14: 2566. //doi.org/10.3390/foods14152566
- 3) Tian XR, Zhang ZF, Chang J, Hou WW, Li JH, Shi CL*. (2025) Driver identification for resistome transmission of food-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus ST398. Food Bioscience, 68: 106517. //doi.org/10.1016/j.fbio.2025.106517.
- 4) Chang J, Yue M, Zhao G, Tang B*, Shi C*. (2025) Advancements in function recognition of staphyloxanthin and targeted inhibitor development. Current Opinion in Food Science, 63: 101300. //doi.org/10.1016/j.cofs.2025.101300.
- 5) Zhang ZF, Hu MJ, Arunachalam K, Shi CL*. (2025) Genomics revealed novel chromosomal integration of antimicrobial resistance cluster tet(B), sul2, blaTEM-1B, aph(3'')-Ib, and aph(6)-Id in Salmonella Typhimurium. Foodborne Pathogens and Disease, epub online 16 May 2025. //doi.org/10.1089/fpd.2024.0172
- 6) Zhang Z, Zhao H, Shi C*. (2025) Clonal spread and genetic mechanisms underpinning ciprofloxacin resistance in Salmonella Enteritidis. Foods, 14: 289. //doi.org/10.3390/foods14020289
- 7) Shi CL*, Kang SM*. (2024) Foodborne Pathogenic Bacteria: Prevalence and Control-Volume I. Foods, 13(10): 1531.
- 8) Zhang ZF, Shi CL*. (2024) A systematic review of expanding Salmonella enterica serovar Indiana from China: Prevalence, antimicrobial resistance and genomic characterization. Food Bioscience, 62: 105248. //doi.org/10.1016/j.fbio.2024.105248
- 9) Zhang ZF, Hu MJ, Xu XB, Lv C, Shi CL*. (2024) Dynamic antimicrobial resistance and phylogenomic structure of Salmonella Typhimurium from 2007 to 2019 in Shanghai, China. Microbiology Spectrum, 12(8):e00262-24. //doi.org/10.1128/spectrum.00262-24
- 10) Zhang ZF, Kuang D, Xu XB, Zhan ZQ, Ren H, Shi CL*. (2024) Dissemination of IncC plasmids in Salmonella enterica serovar Thompson recovered from seafood and human diarrheic patients in China. International Journal of Food Microbiology, 417: 110708. //doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2024.110708.
- 11) Chang J, Chen B, Du ZQ, Zhao BW, Li JH, Li ZY, Arunachalam K, Shi T, Wei DQ, Shi CL*. (2024) Eugenol targeting CrtM inhibits the biosynthesis of staphyloxanthin in Staphylococcus aureus. Food Science and Human Wellness, 13(03):1368-1377. //doi.org/10.26599/FSHW.2022.9250115.
- 12) Chang J, Zhang Y, Zhang ZF, Chen B, He SK, Zhan ZQ, Zhong N, Tian XR, Kang SM, Arunachalam K, Shi CL*. (2023) Prevalence, antimicrobial resistance, and genetic characteristics of Staphylococcus aureus isolates in frozen flour and rice products in Shanghai, China. Current Research in Food Science, 7:100631. //doi.org/10.1016/j.crfs.2023.100631.
- 13) Arunachalam K, Ravi J, Tian XR, Shunmugiah KP, Shanmugaraj G*, Shi C*. (2023) Antibacterial activity of 2-hydroxy-4-methoxybenzaldehyde and its possible mechanism against Staphylococcus aureus. Journal of Applied Microbiology,134(7):lxad144. //doi.org/10.1093/jambio/lxad144
- 14) Arunachalam K, Krishnan GP, Sethuraman S, Sybiya VP, Thirukannamangai KS, Aakhansha V, Arunkumar J, Shi C*, MubarakAli D*. (2023) Exploring the possible ways to enhance the potential and use of natural products through nanotechnology in the battle against the biofilms of foodborne bacterial pathogens. Pathogens, 12(2): 270.
- 15) Arunachalam K, Poonguzhali P, Shi C*, Lagoa R* (2023) Regulation of Staphylococcus aureus virulence and application of nanotherapeutics to eradicate S. aureus infection. Pharmaceutics, 15(2): 310.
- 16) Hou WW, Kang SM, Chang J, Tian XR, Shi CL*. (2022) Correlation analysis between GlpQ-regulated degradation of wall teichoic acid and biofilm formation triggered by lactobionic acid in Staphylococcus aureus. Foods, 11(21): 3438. //doi.org/10.3390/ foods11213438
- 17) Zhang ZF, Tian XR, Shi CL*. (2022) Global spread of MCR-producing Salmonella enterica isolates. Antibiotics-Basel, 11(8): 998. //doi.org/10.3390/antibiotics11080998
- 18) Zhang ZF, Zhan ZQ, Shi CL*. (2022) International spread of Tet(X4)-producing Escherichia coli isolates. Foods, 11(14): 2010. //doi.org/10.3390/foods11142010
- 19) Martinengo P, Kannappan A, Shi C*. (2021) Polyphenolic Antibacterials for Food Preservation: review, challenges and current applications. Foods, 10: 2469.
- 20) Shang DQ, Zhao H, Xu XB, Kannappan A, Chang J, Bai L, Shi CL*. (2021) Conjugative IncHI2 plasmid harboring novel class 1 integron mediated dissemination of multidrug resistance genes in Salmonella Typhimurium. Food Control, 122: 107810. doi: 10.1016/j.foodcont.2020.107810.
- 21) Ou CJ, Shang DQ, Yang JX, Chen B, Chang J, Jin FN, Shi CL*. (2020) Prevalence of multidrug-resistant Staphylococcus aureus isolates with strong biofilm formation ability among animal-based food in Shanghai. Food Control, 112: 107106. doi: 10.1016/j.foodcont.2020.107106.
专利著作
- 施春雷, 杨捷琳, 史贤明, 刘斌, 潘良文, 袁辰刚. 蜡样芽孢杆菌的检测方法及试剂盒,专利号ZL201210308753.X, 授权日2014年6月11日
- 施春雷, 杨捷琳, 史贤明, 刘斌, 潘良文, 袁辰刚. 一种蜡样芽孢杆菌的检测方法及试剂盒, 专利号ZL201410253239.X，授权日2016年8月17日
- 施春雷, 庄孝飞, 周秀娟, 史贤明, 崔妍. 一种沙门氏菌血清型鉴定方法及其试剂盒, 专利号ZL201410293102.7, 授权日2016年8月24日
- 施春雷, 区楚君, 尚岱麒, 常江, 杨婧娴, 陈博. 一种消除食品背景杂菌干扰的金黄色葡萄球菌分离方法, 专利号ZL202010601463.9, 授权日2022年05月31日
- 施春雷, 陈博, 常江, 杨婧娴, 侯宛宛. 一种抑制葡萄球菌黄素合成的方法及其应用, 专利号ZL202111442761.9，授权日2024年11月26日
获奖
- 2012年获国家质检总局“科技兴检奖”二等奖，第七完成人。
- 2014年获上海市浦东新区科技进步二等奖，第三完成人。
- 2019年获中国商业联合会科技进步三等奖，第二完成人。
- 2019年jk萝莉 优秀班主任。
- 2021年获浙江省科技进步三等奖，第三完成人。
- 2021年获（中国工程院）中国工程前沿杰出青年学者。
- 2022年1月17日获中华人民共和国海关总署“科技兴关”科技成果三等奖，第三完成
荣誉
- 2024年入选上海市东方英才计划拔尖项目（教育平台）（BJJY2024054）。